1996年1月，苏州市郊、吴县市信用联社分别与市郊农行、吴县市农行脱离行政隶属关系，独立对外营业。1999年9月，实行统一法人，由单个法人信用社合并为以县联社为单位的统一法人。2001年3月，随着吴县市撤市建区，吴县市农村信用合作联社辖区相应变为苏州市吴中、相城两区。苏州市郊农村信用合作联社辖区主要是现苏州市工业园区和高新区两区。

2002年12月18日，苏州市郊农村信用联社与吴县市农村信用联社合并重组正式成立苏州市区农村信用合作联社，下辖吴中区、相城区、高新区、工业园区四个区信用社，机构网点遍布苏州市区城乡。

经中国银行业监督管理委员会批准，苏州市区农村信用合作联社组建为江苏东吴农村商业银行股份有限公司，并于2004年12月28日正式对外挂牌开业，成为全国第5家股份制农村商业银行。

2010年9月28日，经中国银监会批准，江苏东吴农村商业银行正式更名为苏州银行股份有限公司，开辟了我行发展历史的新篇章。

2011年3月17日，经中国银监会银监复〔2011〕82号文件批准，苏州银行股份有限公司监管隶属关系由农村中小金融机构监管序列调整为中小商业银行监管序列，标志我行的行业性质正式由农村商业银行转变为城市商业银行。